Организационный аудит — контроль механизма и структуры управления организацией на основе принятых стандартов, норм, законов и принципов. Это контроль организационной структуры (структурных связей и бизнес-процессов), выявление соответствия организационной структуры масштабам и характеру деятельности предприятия. Аудит должен определить цели, задачи, функции, стоимость и способность к развитию созданной структуры. Аудит проводиться с целью выявления организационных и финансовых рисков структуры, а также финансовых потерь предприятия, к которым могут привести эти риски.

Аудиты организационной структуры управления включают определение организационной структуры, описание распределения полномочий и ответственности сотрудников и подразделений, выработку политики предприятия, положений о подразделениях, должностных инструкций, принципов планирования, учета, анализа и принятия решений во всех категориях менеджмента (маркетинг, логистика, производство, др). Анализ различных вариантов построения системы управления позволит руководителям предприятия или обособленного подразделения упорядочить деятельность и снизить общие затраты на осуществление эффективного управления предприятием.Результаты аудита организационной структуры, оформленные отчетами, картами процессов и опросными листами позволят руководителям предприятия получить полную, достоверную и непротиворечивую информацию о состоянии системы управления. Эти данные послужат отправной точкой для проведения изменений и позволят установить ключевые направления совершенствования предприятия.  Анализ истинных причин возникновения несоответствий и противоречий в организационной структуре позволит руководителям добиться должного эффекта при проведении организационных преобразований. Результаты аудита также помогут правильно выбрать модели управления различными категориями менеджмента.